Setelah ayah Koutarou Satomi tiba-tiba dipindahkan untuk pekerjaannya, siswa tahun pertama sekolah menengah dihadapkan dengan mencari tempat yang murah untuk tinggal sendiri. Secara alami, dia melompat pada kesempatan untuk pindah ke Kamar 106 Corona House hanya dengan lima ribu yen sebulan. Tapi sementara semuanya berjalan baik pada awalnya, Koutarou segera mendapat lebih banyak daripada yang dia tawar setelah menemukan sebuah gua misterius saat mengerjakan pekerjaan paruh waktunya.
Malam berikutnya, Koutarou dikunjungi oleh berbagai tokoh yang tampaknya mitos, yang semuanya mengklaim kepemilikan apartemen siswa miskin itu. Di antara penjajah adalah Sanae Higashihongan, hantu yang diduga menghantui ruangan, gadis ajaib Yurika, putri alien Theiamillis Gre Fortorthe, dan Kiriha Kurano, keturunan langsung Manusia Bumi. Tetapi yang lebih penting, masing-masing dari keempat gadis ini membutuhkan apartemen Koutarou karena alasannya sendiri dan tidak akan kembali tanpa perlawanan!
Rokujouma no Shinryakusha !? adalah komedi pertempuran royale atas apartemen enam-tatami tikar yang melibatkan makhluk gaib, pacar sekolah menengah romantis, dan induk semang ramah tipuan.