Anohana: The Flower We Saw That Day Jinta Yadomi hidup damai sebagai pertapa, menghabiskan hari-harinya jauh dari sekolah dan bermain video game di rumah saja. Suatu hari di musim panas, teman masa kecilnya, Meiko “Menma” Honma, muncul dan menggumamkannya untuk mengabulkan harapan yang terlupakan. Dia tidak memedulikannya, yang mengganggunya, tetapi dia tidak benar-benar peduli. Bagaimanapun, Menma sudah mati bertahun-tahun yang lalu.
Pada awalnya, Jinta berpikir bahwa dia hanya berhalusinasi karena panasnya musim panas, tetapi dia kemudian yakin bahwa yang dia lihat benar-benar adalah hantu Menma. Jinta dan kelompok teman masa kecilnya tumbuh terpisah setelah kematiannya yang terlalu cepat, tetapi mereka disatukan sekali lagi ketika mereka mencoba untuk meletakkan semangat Menma untuk beristirahat. Menghidupkan kembali rasa sakit dan rasa bersalah mereka, akankah mereka dapat menemukan kekuatan untuk membantu tidak hanya Menma yang terus maju — tetapi juga diri mereka sendiri?