Tenma Matsukaze adalah siswa baru di SMP Raimon. Karena cintanya pada sepak bola, ia memutuskan untuk bergabung dengan tim sepak bola sekolah, yang memperoleh reputasinya setelah penampilan luar biasa yang ditunjukkan sepuluh tahun sebelumnya di Football Frontier International, sebuah turnamen yang menyelenggarakan tim-tim pemuda terbaik di dunia yang ditawarkan. Sayangnya, sekolah yang dulu terkenal itu tidak memiliki semangat sepakbola yang pernah dinikmati.
Hal ini terutama disebabkan oleh kenyataan bahwa sepak bola di Jepang sekarang dikendalikan oleh entitas gelap yang dikenal sebagai “Sektor Kelima.” Mereka sendiri yang menentukan nasib setiap pertandingan, menginstruksikan tim untuk menang atau kalah. Tindakan Sektor Kelima telah mengalahkan tim-tim sepak bola negara itu, yang tidak lagi mencintai permainan ini.
Tenma dan rekan-rekan satu timnya akan berupaya mengubah paradigma ini dan melawan penindas jahat mereka. Untungnya, mereka tidak akan sendirian dalam pertempuran ini, karena mereka akan mendapat bantuan dari kelompok yang dikenal sebagai “Perlawanan.” Bersoraklah pada anak-anak lelaki Inazuma Eleven Go saat mereka bertarung dengan pertarungan yang bagus!
