Di fasilitas penelitian yang tersembunyi di pulau terpencil, programmer jenius Shiki Magata telah hidup sebagai pertapa selama bertahun-tahun. Dia jarang bertemu tamu, tetapi profesor asosiasi Souhei Saikawa dan mahasiswa universitas Moe Nishinosono masih mencarinya. Namun, pertemuan mereka terputus ketika mereka terjebak dalam misteri pembunuhan di kamar terkunci.
Segalanya tidak seperti kelihatannya, dan banyak rahasia tersembunyi. Dalam fasilitas yang terisolasi, kejahatan yang tampaknya mustahil dan mengerikan terjadi, dan Saikawa dan Moe harus mengungkap kebenaran di balik pembunuhan dan masa lalu yang diselimuti Magata.