Daikichi Kawachi adalah seorang bujangan berusia 30 tahun yang melakukan pekerjaan yang terhormat tetapi sebaliknya hidup tanpa tujuan. Ketika kakeknya tiba-tiba meninggal, dia kembali ke rumah keluarga untuk memberikan penghormatan. Setelah tiba di rumah, ia bertemu dengan seorang gadis muda misterius bernama Rin yang, yang membuat Daikichi heran, adalah putri haram kakeknya!
Gadis yang pemalu dan tidak dapat didekati itu dianggap memalukan bagi keluarga, dan mendapati dirinya dikucilkan oleh kerabat ayahnya, semuanya menolak untuk merawatnya setelah kematiannya. Daikichi, yang marah karena sikap dingin mereka terhadap Rin, mengumumkan bahwa dia akan menerimanya — terlepas dari kenyataan bahwa dia masih muda, pria lajang tanpa pengalaman pengasuhan anak sebelumnya.
Usagi Drop adalah kisah perjalanan Daikichi melalui peran sebagai ayah ketika ia membangkitkan Rin dengan sifatnya yang lembut dan penuh kasih sayang, serta penjelajahan kehangatan dan saling ketergantungan yang berada di jantung keluarga yang bahagia dan dekat.
