Siswa sekolah menengah Homura Suzuko telah kembali ke Ikebukuro, kota tempat dia dibesarkan.
“Kami berteman selamanya!” Dia menghargai ingatannya tentang teman lamanya sejak masih kecil, Morikawa Chinatsu, dan dia senang melihat prospek bertemu dengannya lagi.
Tetapi ketika dia sampai di sekolah, dia menemukan bahwa dia mengalami kesulitan menyesuaikan diri dengan anggota kelas lainnya.
Suatu hari, dia memutuskan bahwa jika dia belajar bermain permainan kartu WIXOSS, dia mungkin dapat membuat beberapa teman. Dia berhenti di sebuah toko kartu dalam perjalanan pulang dan membeli set dek. Ketika dia membawa set itu pulang dan membukanya, gadis di salah satu kartu mulai bergerak, dan berbicara.
“Selamat datang, Selector.”
Manusia yang dipilih sebagai Penyeleksi harus bertarung untuk mengendalikan lima koin yang menyimpan semua ingatan mereka.
Jika mereka dapat mengambil kembali semua koin, mereka menang, dan dapat meninggalkan permainan. Tetapi jika mereka kalah, sebagai penalti—
“Lostorage” —Apa yang akan terjadi pada Suzuko saat dia terjebak dalam game gila ini?
Dan seperti halnya Suzuko, Chinatsu juga tertarik pada permainan …