Sihir itu tidak nyata — semua orang tahu itu. Namun, ketika dilakukan oleh seorang ahli sejati, sihir memiliki kemampuan untuk memukau dan membuat heran para pendengarnya. Kaito Kuroba, putra pesulap panggung terkenal dunia Touichi Kuroba, tidak asing dengan fakta ini. Berpengalaman dalam seni penipuan dan penyesatan, Kaito sering mengganggu kehidupan orang-orang di sekitarnya dengan trik dan lelucon yang mencolok. Tetapi ketika Kaito secara tidak sengaja menemukan lorong tersembunyi di rumahnya, ia menemukan sebuah rahasia yang mungkin menjadi penyebab kematian ayahnya delapan tahun lalu — pakaian putih merpati Kid the Phantom Thief. Ingin mengetahui lebih banyak tentang ayahnya, Kaito mengenakan pakaian itu dan mencari Pandora Gem yang konon mengabulkan keabadian. Akan tetapi, dia bukan satu-satunya setelah permata itu — organisasi yang bertanggung jawab atas kematian ayahnya juga sangat bersemangat!
Magic Kaito mengikuti kelahiran kembali Kaitou Kid, pencuri hantu malam itu. Memanfaatkan boneka tiruannya, penyamaran, dan pistol kartu tanda tangan, Kaito berangkat untuk mencuri perhiasan yang paling berharga di dunia, mengungkap kebenaran di balik kematian ayahnya dan Permata Pandora yang digosipkan di sepanjang jalan.
