Hope’s Peak Academy adalah sekolah menengah elit yang hanya menerima siswa paling berbakat. Individu yang berhasil mendaftar menerima gelar unik mereka sendiri, sesuai dengan keterampilan dan sifat mereka. Dari lima belas kandidat yang diterima di sekolah khusus tahun itu, Makoto Naegi adalah individu yang sepenuhnya biasa yang telah diterima secara kebetulan, dengan judul “Keberuntungan Tingkat Sekolah Super Tinggi.”
Naegi dan teman-teman sekelasnya pada awalnya sangat gembira untuk dipilih untuk belajar di institusi bergengsi ini, tetapi perasaan bahagia ini berumur pendek. Mereka segera dihadang oleh Monokuma, kepala sekolah dan beruang residen, yang menjebak mereka di dalam sekolah. Harapan para murid untuk melarikan diri dan kelulusan bergantung pada salah satu dari mereka yang berhasil membunuh salah satu rekan mereka tanpa diketahui. Namun, jika si pembunuh tertangkap, ia akan dieksekusi, dan para penyintas yang tersisa akan dibiarkan melanjutkan pertandingan kematian sampai hanya satu pemenang yang tersisa.
