Shuuichi Nitori, siswa kelas lima yang bungsu, dianggap oleh sebagian besar sebagai salah satu gadis tercantik di sekolah, tetapi yang membuatnya kecewa, dia sebenarnya secara biologis laki-laki. Untungnya, Shuuichi memiliki teman masa kecil yang memiliki perasaan tidak nyaman yang sama terkait dengan identitas gender: tomboi kurus Yoshino Takatsuki, yang, meskipun secara biologis perempuan, tidak mengidentifikasi sebagai seorang gadis. Kedua sahabat ini berbagi rahasia yang sama dan menemukan penghiburan satu sama lain; Namun, kehidupan mereka menjadi lebih rumit ketika mereka harus menginjak perairan yang tidak dikenal dari sekolah baru, berusaha untuk mendapatkan teman baru, dan berjuang untuk mempertahankan yang lama. Menghadapi peluang yang hampir tidak dapat diatasi, mereka harus belajar menghadapi kenyataan keras tentang tumbuh dewasa, transeksualitas, hubungan, dan penerimaan.
Dipuji sebagai tindakan serius terhadap identitas gender dan perjuangan LGBT, Hourou Musuko dari Takako Shimura bercerita tentang upaya Shuuichi dan Yoshino untuk menemukan diri mereka yang sebenarnya ketika memasuki masa puber, berteman, jatuh cinta, dan menghadapi beberapa pilihan yang sangat nyata dan sulit.
