Ini adalah tahun 1999. Morioh, sebuah kota yang biasanya tenang dan damai, baru-baru ini menjadi sarang aktivitas aneh. Joutarou Kuujou, sekarang seorang ahli biologi kelautan, menuju ke kota misterius untuk bertemu Jousuke Higashikata. Meskipun keduanya mungkin terlihat seperti orang asing pada awalnya, Jousuke sebenarnya adalah anak haram kakek Joutarou, Joseph Joestar. Ketika mereka bertemu, Joutarou menyadari bahwa dia mungkin memiliki lebih banyak kesamaan dengan Jousuke daripada hanya hubungan darah.
Bersama dengan Kouichi Hirose yang santun dan Okuyasu Nijimura yang riuh, kelompok ini mendedikasikan diri mereka untuk menyelidiki penghilangan baru-baru ini dan kejadian mencurigakan lainnya di Morioh. Dibantu oleh kekuatan Stand, keempat lelaki itu akan menghadapi bahaya di setiap sudut jalan, karena terserah mereka untuk mengungkap rahasia kota, sebelum yang lain terjadi.
