Dengan Perang Dunia II di ujung jalan, intelijen tentang situasi sosial dan ekonomi negara lain telah menjadi aset yang berharga. Akibatnya, Jepang telah membentuk organisasi mata-mata baru yang dikenal sebagai “Agensi D” untuk mendapatkan senjata ini.
Di bawah komando Letnan Kolonel Yuuki, delapan agen telah ditugaskan untuk menyusup dan mengamati beberapa negara paling kuat, melaporkan setiap perkembangan yang terkait dengan perang. Untuk melaksanakan tugas-tugas berbahaya ini, orang-orang ini telah melatih tubuh mereka untuk bertahan hidup dalam kondisi ekstrem dan mempelajari berbagai bidang seperti komunikasi dan bahasa. Namun, kekuatan terbesar mereka terletak pada kemampuan mereka untuk memanipulasi orang untuk mendapatkan informasi yang diperlukan untuk memberi bangsa mereka unggul.