Midgar, akademi khusus perempuan, akan terkenal hanya karena tindakan menerima siswa laki-laki pertamanya dan satu-satunya, Yuu Mononobe. Tetapi Midgar lebih menonjol dari itu: itu adalah sekolah khusus untuk sekelompok gadis yang dikenal sebagai D’s. Masing-masing dari mereka memiliki kemampuan yang sangat kuat dalam menghasilkan materi gelap dan memanipulasinya menjadi persenjataan yang kuat.
D tidak ada dua puluh lima tahun yang lalu, dan hanya muncul setelah sejumlah monster misterius dan destruktif yang dikenal sebagai “Naga” mulai muncul di seluruh dunia. Anehnya, sama tiba-tiba ketika mereka muncul, mereka menghilang. Di tengah kehancuran mereka, beberapa gadis mulai terlahir dengan simbol di tubuh dan kekuatan mereka yang serupa dengan yang dimiliki oleh Naga sendiri.
Sekarang D menghadiri sekolah ini, berharap untuk memanfaatkan dan memanfaatkan kekuatan mereka melawan Naga. Yuu adalah anggota terbaru mereka dan luar biasa karena menjadi satu-satunya pria D yang ada. Sekarang dia harus menjalin hubungan dengan gadis-gadis di sekitarnya, termasuk saudara perempuannya yang sudah lama berpisah yang menghadiri sekolah juga, dan bekerja dengan mereka untuk menyelidiki dan menghilangkan ancaman Naga yang kuat.
