Yuu Narukami pindah ke Inaba, sebuah kota yang tampaknya tenang dan biasa, di mana ia dengan cepat berteman dengan siswa pindahan canggung Yousuke Hanamura, Chie Satonaka yang energik, dan pewaris cantik Yukiko Amagi. Tak lama setelah kedatangan Yuu, rantai pembunuhan misterius mulai terjadi pada hari-hari berkabut. Pada saat yang sama, desas-desus tentang saluran televisi yang aneh — dijuluki “Saluran Tengah Malam” – menyebar seperti api; ketika menatap layar TV mereka di tengah malam, seseorang mungkin melihat belahan jiwanya.
Setelah menyaksikan korban pembunuhan terbaru di Saluran Midnight, Yuu mencoba untuk menontonnya lagi, hanya untuk menyadari bahwa ia dapat melintasi TV dan mencapai dunia lain yang dibanjiri dengan “Shadows,” makhluk jahat dari kegelapan. Menyadari hubungan di balik dimensi tersembunyi dan pembunuhan, Yuu dan teman-temannya berusaha memecahkan kasus dengan menjelajahi dunia jahat dari Midnight Channel menggunakan “Persona,” membangkitkan manifestasi dari “diri sejati” mereka.
