Muak dengan masyarakat, anak-anak muda di sekitar Neo-Tokyo membentuk suku untuk menemukan tempat mereka di dunia. Namun, loyalitas kelompok di antara mereka tumbuh sengit dan sering berujung pada kekerasan. Sebagai tindakan balasan, pemerintah menerapkan UU XB—menyatakan bahwa konflik suku harus diselesaikan melalui Extreme Baseball. Dari pemain yang menggunakan kelelawar yang dapat diperpanjang hingga pelempar yang mengenakan peralatan khusus, Extreme Baseball adalah versi olahraga yang futuristik dengan aturan yang dimodifikasi, lebih sedikit batasan, dan aplikasi teknologi yang aneh.
Ketika sekelompok anak muda menggertak Haru Shirokane yang tidak bertulang, dia diselamatkan oleh pasangan yang tidak terduga: Shun Kamiya dan Taiga. Ternyata, Shun adalah pemain bintang Extreme Baseball yang memimpin Suku Minato, tim peringkat teratas di Kota Minato. Sementara itu, Taiga bertujuan untuk mengalahkan Shun dengan harapan menjadi yang terkuat dalam olahraga tersebut. Dalam serangkaian peristiwa spontan yang memungkinkan Shun menemukan potensi mereka, Taiga dan Haru terikat untuk bergabung dengan Suku Minato.
Saat suku-suku di Kota Minato menghadapi ancaman baru yang dipimpin oleh Oujirou Otori yang misterius, Suku Minato mungkin hanya membutuhkan kekuatan dua pemula baru mereka untuk mengatasi cengkeraman kejahatan.
