Tumbuh sebagai yatim piatu, Yuki Sakurai mempertanyakan alasannya hidup dan kemampuan untuk melihat ingatan menyakitkan seseorang hanya dengan menyentuh mereka. Setelah menerima catatan anonim yang mengatakan padanya untuk mati, Yuki tidak dapat melepaskan perasaan mengomel yang ada di dalam dirinya. Tanpa sepengetahuannya, dia diawasi, baik oleh orang-orang yang ingin melukainya maupun mereka yang ingin melindunginya.
Suatu malam yang berkabut, kehidupan Yuki diselamatkan oleh seorang pria cantik dengan mata perak dan rambut hitam legam — seorang pria yang belum pernah ia temui sebelumnya namun sepertinya akrab. Dengan kedatangan orang asing misterius ini, masa lalu Yuki yang terlupakan telah dibangunkan dan tujuan keberadaannya telah muncul di hadapannya.
Uragiri wa Boku no Namae wo Shitteiru menceritakan kisah seorang remaja laki-laki saat dia menemukan siapa dia dan dari mana dia berasal — semuanya sambil berteman, mengalami pengkhianatan, dan perlahan-lahan menyatukan puzzle masa lalunya.